對于在第二點所述的第1、2種情況下，注銷稅務登記是否要進行企業(yè)所得稅的清算，財稅〔2009〕60號文件第二條進行了明確：

(一)按《公司法》、《企業(yè)破產(chǎn)法》等規(guī)定需要進行清算的企業(yè)。

(二)企業(yè)重組中需要按清算處理的企業(yè)。

按《公司法》、《企業(yè)破產(chǎn)法》等規(guī)定需要進行清算的主要包括以下幾種類型：

1.企業(yè)解散。合資、合作、聯(lián)營企業(yè)在經(jīng)營期滿后，不再繼續(xù)經(jīng)營而解散；合作企業(yè)的一方或多方違反合同、章程而提前終止合作關系解散的。

2.企業(yè)破產(chǎn)。企業(yè)資不抵債，按《破產(chǎn)法》進行清算的。

3.其他原因清算。企業(yè)因自然災害、戰(zhàn)爭等不可抗力遭受損失，無法經(jīng)營下去，應進行清算；企業(yè)因違法經(jīng)營，造成環(huán)境污染或危害社會公眾利益，被停業(yè)、撤銷，應當進行清算的。

企業(yè)重組中需要進行企業(yè)所得稅清算的，依照財政部、國家稅務總局《關于企業(yè)重組業(yè)務企業(yè)所得稅處理若干問題的通知》(財稅〔2009〕59號)規(guī)定，主要包括以下4種類型：

1.企業(yè)由法人轉(zhuǎn)變?yōu)閭€人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)等非法人組織的。

2.企業(yè)將登記注冊地轉(zhuǎn)移至中華人民共和國境外(包括港澳臺地區(qū))的。

3.不適用特殊性稅務處理的企業(yè)合并中，被合并企業(yè)及其股東都應按清算進行所得稅處理。

4.不適用特殊性稅務處理的企業(yè)分立中，被分立企業(yè)不再繼續(xù)存在時，被分立企業(yè)及其股東都應按清算進行所得稅處理。