國家稅務總局烏魯木齊水磨溝區(qū)稅務局的主要職責是：

（一）負責貫徹執(zhí)行黨的路線、方針、政策，加強黨的全面領導，履行全面從嚴治黨責任，負責黨的建設和思想政治建設工作。

（二）負責貫徹執(zhí)行稅收、社會保險費和有關非稅收入法律、法規(guī)、規(guī)章和規(guī)范性文件，研究制定具體實施辦法。組織落實國家規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策。

（三）負責研究擬定稅收、社會保險費和有關非稅收入中長期規(guī)劃，參與擬定稅收、社會保險費和有關非稅收入預算目標并依法組織實施。負責稅收、社會保險絲和有關非稅收入的會統(tǒng)核算工作。組織開展收入分析預測。

（四）負責開展稅收經(jīng)濟分析和稅收政策效應分析，為國家稅務總局烏魯木齊市稅務局和地方黨委、政府提供決策參考。

（五）負責所轄區(qū)域內(nèi)各項稅收、社會保險費和有關非稅收入征收管理。組織實施稅（費）源監(jiān)控和風險管理，加強大企業(yè)和自然人稅收管理。

（六）負責組織實施稅收、社會保險費和有關非稅收入服務體系建設。組織開展納稅服務、稅收宣傳工作，保護納稅人、繳費人合法權益。承擔涉及稅收、社會保險費和有關非稅收入的行政復議和行政賠償事項。

（七）負責所轄區(qū)域內(nèi)國際稅收和進出口稅收管理工作，承辦反避稅調(diào)查和出口退稅事項辦理。

（八）負責組織實施所轄區(qū)域內(nèi)社會保險費、有關非稅收入檢查工作。

（九）負責增值稅專用發(fā)票、普通發(fā)票和其他各類發(fā)票管理。負責稅收、社會保險費和有關非稅收入票證管理。

（十）負責內(nèi)部控制機制建設工作，開展對貫徹執(zhí)行黨中央、國務院重大決策及上級工作部署情況的督察督辦，組織實施稅收執(zhí)法督查。

（十一）負責基層建設和干部隊伍建設工作，加強領導班子建設，承擔稅務人才培養(yǎng)和干部教育培訓工作。負責績效管理和干部考核工作。

（十二）負責編制、經(jīng)費和資產(chǎn)管理工作。

（十三）完成上級稅務部門及地方黨委、政府交辦的其他工作。