擬訂重大疾病防治規(guī)劃、國家免疫規(guī)劃、嚴重危害人民健康公共衛(wèi)生問題的干預措施并組織實施，完善疾病預防控制體系，承擔傳染病疫情信息發(fā)布工作。

設綜合處、監(jiān)測評價處、傳染病防控處、免疫規(guī)劃處、艾滋病防控處、結(jié)核病防控處、寄生蟲病與地方病防控處、慢性病與營養(yǎng)管理處、精神衛(wèi)生處、環(huán)境健康處。